Nachdem sich der hinterlistige Fumito Nanahara aufgrund der Ereignisse in der Ukishima Provinz gezwungen sieht nach Tokio zu fliehen, baut er dort eine mysteriöse Organisation namens "Tower" auf, um die Rebellen auszuschalten. Lediglich eine Gruppe, die sogenannte "Surat", beschließt trotzdem gegen Fumito und seine Pläne anzugehen. Als jedoch ihr Plan, Fumito und "Tower" aus dem Hinterhalt anzugreifen, schief läuft und sie eine Niederlage scheinbar nicht umgehen können, taucht die entschlossene Widerstandskämpferin Saya Kisaragi auf und kann Schlimmeres verhindern. Gemeinsam mit "Surat" will Saya "Tower" und ihrem Befehlshaber Fumito den Krieg erklären, denn sie sinnt auf Rache, nachdem Fumito ihr alles genommen hat, was ihr jemals etwas bedeutete.